MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782206

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014535	TAA	2	6	1105	1110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
2	NC_014535	TAC	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
3	NC_014535	TAAC	2	8	1173	1180	50 %	25 %	0 %	25 %	307591244
4	NC_014535	TGT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591244
5	NC_014535	AAT	2	6	1219	1224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
6	NC_014535	TCTA	2	8	1267	1274	25 %	50 %	0 %	25 %	307591244
7	NC_014535	TAT	2	6	1365	1370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
8	NC_014535	TAA	2	6	1378	1383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
9	NC_014535	TAA	2	6	1424	1429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
10	NC_014535	AAT	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
11	NC_014535	T	6	6	1510	1515	0 %	100 %	0 %	0 %	307591244
12	NC_014535	TTA	2	6	1566	1571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
13	NC_014535	TAAA	2	8	1587	1594	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
14	NC_014535	TAGT	2	8	1628	1635	25 %	50 %	25 %	0 %	307591244
15	NC_014535	TCA	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
16	NC_014535	TAG	2	6	1678	1683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
17	NC_014535	TAA	2	6	1786	1791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
18	NC_014535	AGT	2	6	1899	1904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
19	NC_014535	TAA	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
20	NC_014535	CAT	2	6	1950	1955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
21	NC_014535	GTT	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591244
22	NC_014535	ATTGTT	2	12	2071	2082	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307591244
23	NC_014535	TAA	2	6	2143	2148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
24	NC_014535	CATC	2	8	2195	2202	25 %	25 %	0 %	50 %	307591244
25	NC_014535	ATT	2	6	2290	2295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
26	NC_014535	CTT	2	6	2355	2360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591244
27	NC_014535	ATA	2	6	2413	2418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
28	NC_014535	CTA	2	6	2475	2480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
29	NC_014535	TCA	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
30	NC_014535	TCA	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
31	NC_014535	AATT	2	8	2566	2573	50 %	50 %	0 %	0 %	307591244
32	NC_014535	TCA	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
33	NC_014535	TAA	2	6	2638	2643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
34	NC_014535	CTTG	2	8	2718	2725	0 %	50 %	25 %	25 %	307591244
35	NC_014535	ATA	2	6	2826	2831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
36	NC_014535	ATT	2	6	2848	2853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
37	NC_014535	CTT	2	6	2922	2927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591244
38	NC_014535	GA	3	6	2989	2994	50 %	0 %	50 %	0 %	307591244
39	NC_014535	TAG	2	6	3003	3008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
40	NC_014535	TAA	2	6	3037	3042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
41	NC_014535	CCT	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307591244
42	NC_014535	ATA	2	6	3115	3120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
43	NC_014535	TGAAT	2	10	3137	3146	40 %	40 %	20 %	0 %	307591244
44	NC_014535	TCTA	2	8	3166	3173	25 %	50 %	0 %	25 %	307591244
45	NC_014535	TAAT	2	8	3174	3181	50 %	50 %	0 %	0 %	307591244
46	NC_014535	T	6	6	3189	3194	0 %	100 %	0 %	0 %	307591244
47	NC_014535	CAT	2	6	3195	3200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
48	NC_014535	TAG	2	6	3201	3206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
49	NC_014535	TGAA	2	8	3233	3240	50 %	25 %	25 %	0 %	307591244
50	NC_014535	TAA	2	6	3313	3318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
51	NC_014535	AAAT	2	8	3379	3386	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
52	NC_014535	TCA	2	6	3464	3469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
53	NC_014535	ATTT	2	8	3478	3485	25 %	75 %	0 %	0 %	307591244
54	NC_014535	TAG	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
55	NC_014535	AGACA	2	10	3535	3544	60 %	0 %	20 %	20 %	307591244
56	NC_014535	AAAT	2	8	3575	3582	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
57	NC_014535	TAA	2	6	3645	3650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
58	NC_014535	TAA	2	6	3676	3681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
59	NC_014535	TAAA	2	8	3711	3718	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
60	NC_014535	A	6	6	3730	3735	100 %	0 %	0 %	0 %	307591244
61	NC_014535	AT	3	6	3749	3754	50 %	50 %	0 %	0 %	307591244
62	NC_014535	AATATT	2	12	3763	3774	50 %	50 %	0 %	0 %	307591244
63	NC_014535	T	7	7	3801	3807	0 %	100 %	0 %	0 %	307591244
64	NC_014535	TTAAA	2	10	3828	3837	60 %	40 %	0 %	0 %	307591244
65	NC_014535	TAA	2	6	3844	3849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
66	NC_014535	ATC	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
67	NC_014535	AAGA	2	8	4054	4061	75 %	0 %	25 %	0 %	307591244
68	NC_014535	ATT	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
69	NC_014535	ATT	2	6	4168	4173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
70	NC_014535	TAAA	2	8	4177	4184	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
71	NC_014535	TTA	2	6	4220	4225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
72	NC_014535	ATCT	2	8	4364	4371	25 %	50 %	0 %	25 %	307591245
73	NC_014535	TTAA	2	8	4494	4501	50 %	50 %	0 %	0 %	307591245
74	NC_014535	AAT	2	6	4534	4539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591245
75	NC_014535	TCA	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591245
76	NC_014535	ATC	3	9	4803	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591246
77	NC_014535	ATA	2	6	4821	4826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591246
78	NC_014535	TTA	2	6	4879	4884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591246
79	NC_014535	AATGA	2	10	5070	5079	60 %	20 %	20 %	0 %	307591247
80	NC_014535	CTA	2	6	5122	5127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591247
81	NC_014535	AGTA	2	8	5147	5154	50 %	25 %	25 %	0 %	307591247
82	NC_014535	TAC	2	6	5179	5184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591247
83	NC_014535	GAAA	2	8	5221	5228	75 %	0 %	25 %	0 %	307591247
84	NC_014535	A	6	6	5238	5243	100 %	0 %	0 %	0 %	307591247
85	NC_014535	ATA	2	6	5278	5283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591247
86	NC_014535	CAA	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591247
87	NC_014535	T	6	6	5378	5383	0 %	100 %	0 %	0 %	307591247
88	NC_014535	GTAT	2	8	5405	5412	25 %	50 %	25 %	0 %	307591247
89	NC_014535	TAG	2	6	5413	5418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591247
90	NC_014535	A	7	7	5451	5457	100 %	0 %	0 %	0 %	307591247
91	NC_014535	GAA	2	6	5469	5474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591247
92	NC_014535	T	6	6	5477	5482	0 %	100 %	0 %	0 %	307591247
93	NC_014535	ATA	2	6	5494	5499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591247
94	NC_014535	GT	4	8	5512	5519	0 %	50 %	50 %	0 %	307591247
95	NC_014535	ATT	2	6	5520	5525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591247
96	NC_014535	ATG	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591247
97	NC_014535	T	6	6	5683	5688	0 %	100 %	0 %	0 %	307591248
98	NC_014535	ATTTA	2	10	5840	5849	40 %	60 %	0 %	0 %	307591248
99	NC_014535	CT	3	6	5867	5872	0 %	50 %	0 %	50 %	307591248
100	NC_014535	A	6	6	5873	5878	100 %	0 %	0 %	0 %	307591248
101	NC_014535	TCA	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591248
102	NC_014535	TAAG	2	8	6176	6183	50 %	25 %	25 %	0 %	307591248
103	NC_014535	ATT	2	6	6234	6239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591248
104	NC_014535	CAT	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591249
105	NC_014535	ACCTTT	2	12	6304	6315	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307591249
106	NC_014535	TTA	3	9	6344	6352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591249
107	NC_014535	GTT	2	6	6369	6374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591249
108	NC_014535	A	6	6	6382	6387	100 %	0 %	0 %	0 %	307591249
109	NC_014535	T	6	6	6595	6600	0 %	100 %	0 %	0 %	307591249
110	NC_014535	GATAA	2	10	6657	6666	60 %	20 %	20 %	0 %	307591249
111	NC_014535	AAT	2	6	6765	6770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591249
112	NC_014535	TCA	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591249
113	NC_014535	TC	3	6	7811	7816	0 %	50 %	0 %	50 %	307591250
114	NC_014535	CT	3	6	7895	7900	0 %	50 %	0 %	50 %	307591250
115	NC_014535	TTA	2	6	8114	8119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591250
116	NC_014535	TTA	2	6	8132	8137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591250
117	NC_014535	A	6	6	8248	8253	100 %	0 %	0 %	0 %	307591250
118	NC_014535	TA	3	6	8392	8397	50 %	50 %	0 %	0 %	307591250
119	NC_014535	ATG	2	6	8451	8456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591250
120	NC_014535	TC	3	6	8492	8497	0 %	50 %	0 %	50 %	307591250
121	NC_014535	T	6	6	8562	8567	0 %	100 %	0 %	0 %	307591250
122	NC_014535	T	6	6	8594	8599	0 %	100 %	0 %	0 %	307591250
123	NC_014535	TCA	2	6	8807	8812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591250
124	NC_014535	GAC	2	6	9018	9023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591251
125	NC_014535	AAT	2	6	9064	9069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591251
126	NC_014535	AAG	2	6	9119	9124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591251
127	NC_014535	ATT	2	6	9163	9168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591251
128	NC_014535	A	6	6	9240	9245	100 %	0 %	0 %	0 %	307591251
129	NC_014535	TTA	2	6	9305	9310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591251
130	NC_014535	ACA	2	6	9414	9419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591252
131	NC_014535	ATT	2	6	9451	9456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591252
132	NC_014535	ACG	2	6	9484	9489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591252
133	NC_014535	TAA	2	6	9621	9626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591252
134	NC_014535	ATTA	2	8	9696	9703	50 %	50 %	0 %	0 %	307591252
135	NC_014535	A	6	6	9734	9739	100 %	0 %	0 %	0 %	307591252
136	NC_014535	GATT	2	8	9764	9771	25 %	50 %	25 %	0 %	307591252
137	NC_014535	CTA	2	6	9802	9807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591252
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.